8月に戻ると、国際宇宙ステーション（ISS）の乗組員は、リークがステーションの空気圧のわずかな損失の原因であると知り驚いた。調査の結果、原因はISSとドッキングしたロシアのソユーズ宇宙船の小さな穴にあることがわかりました。穴はすみやかに封印されましたが、その原因は謎のままです。
考えられる原因を特定し、宇宙船の外部の穴を検査するために、第57遠征隊の乗組員は12月11日に「前例のない宇宙遊泳」を行いました。機体の外側からサンプルを収集した後、飛行エンジニアのオレグコノネンコとセルゲイプロコピエフは、カプセルの内側から穴が開けられたと結論付け、さらに疑問を投げかけました。
船外活動の過程で、コノネンコとプロコピエフは、宇宙船の断熱材と隕石シールドを開封して、穴をより詳しく検査しました。彼らはまた、穴のデジタル画像を撮り、その後の分析のためにカプセルで地球に戻されたサンプルを入手しました（12月11日）。
当初は隕石に起因するものでしたが、その穴は掘削の結果であることがすぐにわかりました。穴は非常に小さく、空気圧がわずかに低下したため、駅やその乗組員に脅威を与えることはありませんでした。それにもかかわらず、ミッションコントローラーと乗組員が原因を特定した後、エポキシ樹脂とガーゼで穴をふさいで時間を無駄にしませんでした。
乗組員の分析結果は、プロコピエフと乗組員のセリーナアウノンチャンセラー（NASA）とアレクサンダーガースト（欧州宇宙機関）が地球に戻った直後の記者会見で共有されました。穴は、地球の大気圏に再突入する前に投棄されていたため、帰還中に脅威を与えることはありませんでした。
プロコピエフが示したように、空洞はカプセルの内部から始まっており（内部から掘削されたことを意味します）、ロシアの法執行機関が原因を調査しています。プロコピエフはまた、穴が意図的に開けられたという噂を退けました、それは彼が9月に戻って行った声明の結果として現れました。
当時、ロゴジンは、穴が製造されたとき、または軌道に乗っているときに、意図的に穴が開けられたという事実を除外する用意はないと述べていました。これは、ドリルホールが妨害行為の一部であった可能性があるという噂を生み出しました。噂は、元宇宙飛行士とロシアの政治家マキシム・スラエフの発言によりさらに煽られました。
9月4日、ドゥマ州での漏洩についての話し合いの中で、スラエフは、精神的不安定が一因となった可能性について率直に語りました。 「私たちは皆生きているので、誰もが帰宅したいと思うかもしれませんが、この方法はまったく価値がありません」と彼は言った。 「それを行ったのが宇宙飛行士であり、これが除外できない場合、それは絶対に悪いです。」
9月6日、彼はもう一度この可能性を探り、次のように付け加えました。
「しかし、それが宇宙で起こり、委員会によって確立される場合、私はもう一度、真空が存在するため、精神的に不安定な人である宇宙を飛んでいる愚か者だけが穴を開け始めることができることを確認できます、あなたはあなた自身であるだけでなく、あなたは危険にさらされています。あなたは正気ではありません。しかし、私は誰のせいでもありません。」
ロゴジンはその後、これらの発言を後退させ、ニュースメディアが彼の言葉を歪めたと主張した。その時、彼は妨害が遠隔の可能性であったとしても、調査が本当の原因を決定するであろうことは明らかでした。プロコピエフは記者会見で、宇宙飛行士が意図的に穴をあけた可能性があるという考えも却下した。 「私たちの乗組員をそんなに悪く考えてはいけません」と彼は言った。
これらの最新の声明は、ドリルホールの原因についての憶測を阻止するためにはあまり効果がありませんでした。ただし、NASAとロシアの当局は、穴の原因は不明であり、完全に調査されることを強く主張しています。会議中にプロコピエフが要約したように、「その穴がいつ開いたかを判断するのは調査機関次第です」。
彼はまた、この事件がISSの乗組員の準備のレベルを実証したことを指摘することは確実でした。宇宙飛行士が穴をすばやく特定して修理した方法は、「乗組員はどんな開発にも準備ができていた」ことを示したと彼は言った。一方、ISSでの運用は継続されており、12月20日には第58遠征隊が運用を開始しています。
乗組員は、オレグコノネンコ（穴を塞ぎ、船外活動に参加した）の指揮下にあり、NASAの宇宙飛行士アンマクレーンとデビッドサンジャックが飛行エンジニアとして含まれています。
